Conocer el origen y los procesos de los componentes químicos de los sistemas acuáticos permite entender el funcionamiento de los ecosistemas así como evaluar el impacto de las múltiples actividades humanas en los mismos. La composición química tanto de agua, sedimentos y organismos ha permitido: establecer normas que definen la salud de los sistemas acuáticos, inferir el origen de los componentes químicos presentes en el sistema así como estudiar el movimiento de las masas de agua y de sedimentos superficiales en las zonas costeras.

La geoquímica igualmente es una herramienta que juega un papel muy importante ya que aporta datos más específicos del tiempo, cantidad, conservación o degradación de diferentes elementos, metales pesados, ciclaje de nutrientes etc, que muchas veces se convierten en contaminantes y con este tipo de análisis se generan proyectos de bioremedación a diferentes plazos en sistemas marinos, costeros y limnológicos.

Algunas subdisciplinas que se cultivan en esta área son:

Biogeoquímica acuatica

• Flujos de elementos biolimitantes en los ecosistemas acuáticos y su interacción con la productividad primaria

Manejo y Conservación de ecosistemas marinos y costeros

• Manejo, conservación y restauración de ecosistemas de manglar.
• Impacto ambiental, ordenamiento y ecotecnología de humedales costeros.
• Productividad primaria de ecosistemas lagunares–estuarinos.
• Química ambiental
• Ecología costera
• Química de Sistemas Acuáticos.
• Especiación, cinética de deserción de metales traza en aguas naturales y sedimentos y el efecto de superoxidantes
• Termodinámica del sistema del dióxido de carbono en agua de mar.
• Manejo integral del ambiente marino y costero.

Geoquímica ambiental

• Distribución y acumulación de metales pesados en organismos acuáticos.
• Bioremediación de la contaminación por metales pesados en ambientes acuáticos.
• Ciclaje de nutrientes y metales pesados en los ecosistemas acuáticos.
• Geocronología reciente de la contaminación en el medio acuático.
• Contaminantes orgánicos persistentes en los sistemas acuáticos: distribución, destino y efectos.
• Utilización de isótopos estables en estudios ambientales.
• Distribución y acumulación del mercurio en organismos y sistemas acuáticos.
• Geoquímica Orgánica Marina.
• Contaminación Marina y Costera

Toxicología

• Ecotoxicología
• Floraciones microalgales nocivas y tóxicas
• Biotoxinas y sus efectos en organismos acuáticos