Paty

...Dra. Patricia THOMÉ ORTIZ

Investigadora Titular A T.C.

Especialidad: Microbiología Marina y Biología Molecular. Mecanismos moleculares que regulan las respuestas a condiciones sub-óptimas o de estrés (nitrógeno, alta temperatura, salinidad). Estudios de la regulación en la simbiosis Cnidarios – algas dinoflageladas.

Educación: Lic.: Univ. Autónoma Metropolitana, Maestría: Universidad Nacional Autónoma de México, Doctorado: Univ. de California, Santa Barbara.

Antigüedad: Agosto 1996

Lab. 5. Microbiología Marina

Tel:+52(998) 87-10219 ext. 169
E-mail: [email protected]

Research Scientist, Level A

Specialty: Marine Microbiology and Molecular Biology. Molecular mechanisms that regulate the responses to sub-optimal and stress conditions (nitrogen, high temperature, salinity). Regulation studies in Cnidarian – dinoflagellate algal symbiosis.

Education: B.Sc. Autonomous Metropolitan Univ., M.Sc. National Autonomous University of México, Ph.D. Univ. of California, Santa Barbara.

Tenure: August 1996

Investigación

Todos los organismos han evolucionado mecanismos para detectar y responder a condiciones sub- óptimas de su ambiente, y en este sentido los microorganismos han provisto tradicionalmente de sistemas modelo. Mi investigación se centra en identificar las bases fisiológicas y moleculares de la respuesta al estrés. Abarcamos aspectos de fisiología, genética, bioquímica y biología molecular.

En la simbiosis entre cnidarios y dinoflagelados del género Symbiodinium, desde los años 50’s se sabe que el carbono fijado por las algas simbiontes es transferido al animal hospedero, el que se beneficia incrementando sus tasas de crecimiento y calcificación (en corales). Pero el mecanismo de esta transferencia ha permanecido oscuro. Actualmente trabajamos la hipótesis de la existencia de una condición sub-óptima nutricional que podría estimular el flujo continuo de carbono reducido para el bienestar del hospedero. Nuestro principal objetivo es comprender los mecanismos que regulan el flujo de carbono en esta simbiosis.

Los animales hospederos usan parte del carbono transferido para sintetizar una capa de mucopolisacáridos que protege a los tejidos y sustenta una comunidad bacteriana asociada. Estudiamos cómo el tipo de alga simbionte y las condiciones ambientales en las que vive el animal “holosimbionte” (animal + algas simbiontes + comunidad bacteriana), podrían afectar la estructura de esta comunidad. También estamos interesados en describir que define la capacidad protectora de la capa de mucopolisacáridos, desde una perspectiva inmunológica.

Docencia
Imparto cursos a nivel posgrado y como tutor, director de tesis y sinodal en el programa de Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología.

Activitidades Académicas
Evalúo proyectos de investigación básica en agencias gubernamentales y reviso artículos de investigación que son enviados para su publicación a diversas revistas indexadas de alto impacto, de circulación internacional.

Soy tutor del Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología, miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SIN) y de la red de evaluadores científicos nacionales del CONACyT (RCREA).

Research Summary

All living organisms have evolved mechanisms to detect and respond to sub-optimal environmental conditions, where microorganisms have traditionally provided with model systems. My research focuses on the physiological and molecular basis of stress responses. We take physiological, genetic, biochemical and molecular biology approaches.

In the symbiosis between Cnidaria and dinoflagellates in the genus Symbiodinium, it is known since the 50’s that the carbon fixed by the symbiotic algae is transferred to the animal host, which benefits by increasing its growth and calcification (in corals) rates. But the mechanism of such transfer has remained obscure. We are presently working with the hypothesis that there is a nutritional suboptimal condition that may stimulate the continuous flow of reduced carbon for the wellbeing of the animal host. Our main goal is to understand the mechanisms that regulate the flux of carbon in this symbiosis.

Host animals use some of the transferred carbon to synthesize a mucoplysaccharide layer that protects the animal tissues and sustains an associated bacterial community. We study how the symbiont type and the prevailing environmental conditions where the “holosymbiont” (animal + symbiotic algae + bacterial community) lives, could affect the structure of this community. We are also interested in describing what defines the protective ability of the mucopolysaccharide layer, from an immunological perspective.

Teaching & Training
I teach graduate courses and participate as mentor and tutor in the Graduate Program in Marine and Limnology Sciences.

Academic Activities
I review research proposals in basic science for government agencies, as well as manuscripts submitted for publication in diverse indexed scientific journals of high impact with international circulation.

I am mentor in the Graduate Program in Marine Sciences and Limnology, a member of the National Researchers System (SNI) and of the national web of scientific reviewers for CONACyT (RCREA).

Publicaciones Representativas | Representative Publications

Molina VH, Castillo-Medina RE, Thomé PE (2017). Experimentally induced bleaching in the sea anemone Exaiptasia supports glucose as a main metabolite associated with its symbiosis. Journal of Marine Biology, 2017, article ID 3130723

Castro DE, Murguía-Romero M, Thomé PE, Peña A, Calderón-Torres M (2017) Putative 3-nitrotyrosine detoxifying genes identified in the yeast Debaryomyces hansenii: In silico search of regulatory sequences responsive to salt and nitrogen stress. Electronic Journal of Biotechnology.

Cabrales-Arellano P, Islas-Flores T, Thomé PE, Villanueva MA (2017) Indomethacin reproducibly induces metamorphosis in Cassiopea xamachana scyphistomae. PeerJ 5:e2979 https://doi.org/10.7717/peerj.2979

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Beltrán Y, Cerqueda-García D, Tas N, Thomé PE, Iglesias-Prieto R, Falcón LI (2016) Microbial composition of biofilms associated with lithifying rubble of Acropora palmata branches. FEMS Microbiology Ecology 92, fiv162. doi: 10.1093/femsec/fiv162

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Tesis Dirigidas |Directed Thesis

Molina Hernández, V.H. Deteción de enzimas y metabolitos trascendentes en el transporte de carbono en cnidarios bajo condiciones simbióticas y aposimbióticas. Tesis de Licenciatura, Instituto Técnico de Morelos. Abril, 2016.

Suescun Bolívar, L.P. Producción del glicerol en algas del género Symbiodinium bajo estrés osmótico. Tesis de Maestría, PCML, UNAM. 2011.

Díaz Almeyda, E.M. Composición y estabilidad diferencial de la membrana fotosintética de dinoflagelados simbiontes en respuesta a temperatura elevada. Tesis de Maestría, PCML, UNAM. Enero, 2009.

Calderón Torres, C.M. Análisis de la expresión genética diferencial de Debaryomyces hansenii en ambientes hipersalinos. Tesis de Doctorado, PCML, UNAM. 2006.

Beltrán Ramírez, V.H.. Efecto de la diversidad de simbiontes específicos en el patrón de zonación vertical de corales hermatípicos. Tesis de Maestría, PCML, UNAM. 2002.

Calderón Torres, C.M. Caracterización de proteínas de la levadura marina Debaryomyces hansenii, en condiciones de estrés salino y osmótico. Tesis de Maestría, PCML, UNAM. 2000.

30 January, 2018 13:52